Juan Pimentel es Investigador Científico en el Departamento de Historia de la Ciencia (CCHS, CSIC). Ha sido visiting scholar en la Universidad de Cambridge y profesor invitado en la EHESS, París. Ha sido comisario de las exposiciones Cartografías de lo desconocido (BNE, 2017, con Sandra Sáenz López) y Una vuelta al mundo en la BNE (BNE, 2020).
Entre sus libros figuran La física de la Monarquía. Alejandro Malaspina 1754-1810, (Doce Calles, 1998); Testigos del mundo. Ciencia, literatura y viajes en la Ilustración (Marcial Pons, 2003); o El Rinoceronte y el Megaterio, (Abada, 2010, traducido y publicado en inglés por Harvard University Press, 2017). Su último libro es Fantasmas de la ciencia española (Marcial Pons, 2020).
Junto a su hermano Paco Pimentel, han dirigido y realizado la serie documental Tesoros y fantasmas de la ciencia española (FILMIN, 2021).
